中国是世界上养鱼历史和理论发展最悠久的国家，其中很多养殖实践虽然已经不符合目前水环境恶化的现状，但其中重要的经验和数据对水环境的生态修复仍有重要意义。施肥养鱼中有个重要的经验是：瘦水通常是磷限制，肥水通常是氮限制。该经验应用到大水面富营养化修复就可以理解为：贫、中营养水体以控制磷为主，富营养的水体以控制氮为主。

国外（尤其加拿大）水体的研究结果显示以控制磷而放任氮为抑制富营养化的主要方式，原因是其水体多处于中营养类型以下，水体较深，沉积磷再上浮的量比较少，磷通常是限制因子，所以控制磷是有效的方式。

我国富营养化水体中，尤其东部湖区的浅水湖泊，磷从水底上浮比较容易，而氮由固氮蓝藻和酸雨的输入，更难控制。根据我们目前的试验显示，控制磷更容易。我国北方降雨量少，富营养化湖泊水库中蓝藻优势度不高，控制氮的输入仍然是有效控制富营养化的方式，仍符合上述肥水养鱼的经验。

从对动物的毒性角度，氨氮和亚硝酸盐对水生动物有直接毒性，硝酸盐在动物肠道内可转化为亚硝酸盐，也有潜在的毒性（虽然没有报道，但在长肠道的厌氧环境中，这是必然发生的，尤其对排便次数少的动物），因而从这个角度，在富营养化水体，为了保护水中动物的多样性，维持食物链的畅通，控制氮是必须的。